Jak na Steam Workshop Shoguna 2 zasubskrybujesz jakąś modyfikację to Mod Menedżer powinien ci się automatycznie załączyć i przy uruchamianiu gry będziesz miał takie okienko:

To, że masz starego Shoguna 2 z piwnicy nic nie zmienia, bo i tak przez Steam masz wszystko aktualne